(1)加强对水面垃圾源头的宏观管理，制订相应的规章制度，做好水体堤岸（坡岸）的植被工作，从产生源上积极控制水面垃圾的产生。水面垃圾成因特殊、类别多样、性状复杂、多为低密度杂物，清捞、处理作业难度大、成本高。从长远来看，应该从源头上大力控制；对已经产生的水面垃圾，应实行全过程管理，包括政策、法规的制定，技术、资金的保障，专业规划的制定和实施，配套设施的建设等。
(2)建立完善的水面垃圾政策法规体系，并将其融入市容环境卫生管理与水域管理体系中，形成齐抓共管的局面，有效做好水面垃圾的全范围的管理工作。
水面垃圾的危害性已经引起各级政府的高度重视。但是目前为止，我国还没有系统的关于水面垃圾污染控制的政策或专业性文件。所以，亟须国家首先***相关的政策及指导性文件；各地区（水域）政府及相关部门即可结合自然条件和社会经济发展需求，因地制宜地制定相关的地方政策法规，进而自上而下形成系统的、有针对性的水面垃圾污染防治法政策规体系；便于各地区、各级政府、各个部门协调管理、分级管理
(3)拦截清渣浮排理顺管理体制，建立专职机构，明确职责权限，把水面保洁工作纳入城市日常管理体系。水面垃圾专职管理机构应设在环境卫生机构内，并由环卫部门来协调和其他部门（水务、旅游、航运、交通等）的分工合作。当同一河涌流经多区域时，可协商管理，甚至建立联合管理机构，或委托管理。应规范近海水面垃圾的管理与清捞、处理，重点整治过往船舶、作业船只、近海养殖、滨海旅游等活动向近海抛弃各类垃圾。
